Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3GAP1Q15042 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3GAP1Q15042 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms