Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LAPTM4AQ15012 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LAPTM4AQ15012 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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