Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCAPHQ15003 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
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