Protein–RNA interactions for Protein: Q14CS0

UBXN2B, UBX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2BQ14CS0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBXN2BQ14CS0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms