Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SHPRHQ149N8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SHPRHQ149N8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SHPRHQ149N8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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