Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RAB39AQ14964 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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RAB39AQ14964 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB39AQ14964 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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