Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
RFTN1Q14699 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RFTN1Q14699 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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