Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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UBE4AQ14139 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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UBE4AQ14139 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
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UBE4AQ14139 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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UBE4AQ14139 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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UBE4AQ14139 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBE4AQ14139 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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UBE4AQ14139 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBE4AQ14139 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
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