Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PDE1CQ14123 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE1CQ14123 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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