Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CDK13Q14004 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CDK13Q14004 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
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