Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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PDE6HQ13956 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PDE6HQ13956 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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