Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCINQ13939 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCINQ13939 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CCINQ13939 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CCINQ13939 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CCINQ13939 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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CCINQ13939 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CCINQ13939 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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CCINQ13939 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CCINQ13939 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCINQ13939 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CCINQ13939 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
CCINQ13939 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CCINQ13939 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
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