Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CUL1Q13616 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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CUL1Q13616 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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CUL1Q13616 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CUL1Q13616 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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