Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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NAE1Q13564 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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NAE1Q13564 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NAE1Q13564 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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