Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TOP3AQ13472 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TOP3AQ13472 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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