Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLF1Q13351 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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