Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATMQ13315 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ATMQ13315 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ATMQ13315 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ATMQ13315 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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