Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RPA4Q13156 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RPA4Q13156 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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