Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPS1Q13098 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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GPS1Q13098 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPS1Q13098 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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