Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN1Q12860 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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CNTN1Q12860 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CNTN1Q12860 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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