Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GTF3C1Q12789 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms