Protein–RNA interactions for Protein: Q12483

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, yeastyeast

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNF8Q12483 URA5YML106W 681 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 ICY1YMR195W 384 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 ATX2YOR079C 942 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YOR392WYOR392W 444 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YPL034WYPL034W 498 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YCL023CYCL023C 348 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 MNE1YOR350C 1992 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YNL144CYNL144C 2223 nt1.75□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 CFT2YLR115W 2580 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 CDC53YDL132W 2448 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 AHC2YCR082W 387 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 LIN1YHR156C 1023 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 PDP3YLR455W 915 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YML084WYML084W 309 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 ADF1YCL058W-A 342 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 NCS2YNL119W 1482 nt1.74□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 CDC50YCR094W 1176 nt1.73□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YDR018CYDR018C 1191 nt1.73□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 MSL1YIR009W 336 nt1.73□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 HCS1YKL017C 2052 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YJL086CYJL086C 369 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 RPA34YJL148W 702 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 YAL066WYAL066W 309 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 BRX1YOL077C 876 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 GRR1YJR090C 3456 nt1.72□□□□□ -2.13
SNF8Q12483 MMS22YLR320W 4365 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDR248CYDR248C 582 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 COX3Q0275 810 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YJL147CYJL147C 1149 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 HRI1YLR301W 735 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YNL179CYNL179C 438 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 RIO2YNL207W 1278 nt1.71□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 VPS34YLR240W 2628 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 LRE1YCL051W 1752 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDL163WYDL163W 303 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 VPS74YDR372C 1038 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 RPL37BYDR500C 267 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 HYR1YIR037W 492 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 RAM2YKL019W 951 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 SRP21YKL122C 504 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YLR053CYLR053C 327 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YLR302CYLR302C 363 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 RTP1YMR185W 2946 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 HHT2YNL031C 411 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 DCP1YOL149W 696 nt1.7□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 VPS38YLR360W 1320 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDR341CYDR341C 1824 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDR115WYDR115W 318 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YER068C-AYER068C-A 432 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 HOP2YGL033W 657 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 FSH1YHR049W 732 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YJR023CYJR023C 402 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 TEN1YLR010C 483 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 TRS20YBR254C 528 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YCL007CYCL007C 393 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 NCL1YBL024W 2055 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 SYH1YPL105C 2550 nt1.69□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 NAM7YMR080C 2916 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 NDD1YOR372C 1665 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 IRC10YOL015W 1761 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 DAD1YDR016C 285 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 TSA2YDR453C 591 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 TDA2YER071C 381 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YGL042CYGL042C 306 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 LSM2YBL026W 288 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 LSM7YNL147W 348 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 OST2YOR103C 393 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 BFA1YJR053W 1725 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 UBP1YDL122W 2430 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 VMR1YHL035C 4779 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 PET309YLR067C 2898 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 PEP1YBL017C 4740 nt1.68□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 PBP4YDL053C 558 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDR250CYDR250C 276 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 RSM18YER050C 417 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YGR115CYGR115C 780 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YIP1YGR172C 747 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 NOP10YHR072W-A 177 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 HSH155YMR288W 2916 nt1.67□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt1.66□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 NAN1YPL126W 2691 nt1.66□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 UTP21YLR409C 2820 nt1.66□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 snR59snR59 78 nt1.66□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.66□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 YLR366WYLR366W 306 nt1.66□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 MYO2YOR326W 4725 nt1.65□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 MYO4YAL029C 4416 nt1.65□□□□□ -2.14
SNF8Q12483 RAD6YGL058W 519 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YGR109W-AYGR109W-A 873 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YIL082WYIL082W 873 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 ERG29YMR134W 714 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 RPB5YBR154C 648 nt1.65□□□□□ -2.15
SNF8Q12483 MGR1YCL044C 1254 nt1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.9 ms