Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 MGR1YCL044C 1254 nt2.65□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 TFC4YGR047C 3078 nt2.65□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 RNP1YLL046C 750 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YAR068WYAR068W 486 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 SEN15YMR059W 387 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 ICY1YMR195W 384 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YOR105WYOR105W 327 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YBR032WYBR032W 303 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YPR012WYPR012W 255 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 MSS18YPR134W 807 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 JIP5YPR169W 1479 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 SDC25YLL016W 3147 nt2.64□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 ASG1YIL130W 2895 nt2.63□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 RAM2YKL019W 951 nt2.63□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 LCL2YLR104W 396 nt2.63□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YLR458WYLR458W 381 nt2.63□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YML037CYML037C 1023 nt2.63□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 KSP1YHR082C 3090 nt2.63□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 SKP2YNL311C 2292 nt2.63□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YPR089WYPR089W 2667 nt2.63□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 UTP14YML093W 2700 nt2.62□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 snR13snR13 124 nt2.62□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 RPS12YOR369C 432 nt2.62□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 INP52YNL106C 3552 nt2.62□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 SKT5YBL061C 2091 nt2.62□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YPK1YKL126W 2043 nt2.61□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YDL068WYDL068W 330 nt2.61□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 AAD16YFL057C 459 nt2.61□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 RPL36AYMR194W 303 nt2.61□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 ATP15YPL271W 189 nt2.61□□□□□ -1.99
TY2A-OR1Q12439 YPL276WYPL276W 438 nt2.61□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 PES4YFR023W 1836 nt2.61□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 ATP17YDR377W 306 nt2.6□□□□□ -1.99
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TY2A-OR1Q12439 NUP82YJL061W 2142 nt2.59□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 AYT1YLL063C 1425 nt2.59□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 ESL2YKR096W 3588 nt2.59□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 NIC96YFR002W 2520 nt2.59□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 SUL1YBR294W 2580 nt2.58□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YER079WYER079W 633 nt2.58□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YIL174WYIL174W 228 nt2.58□□□□□ -2
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TY2A-OR1Q12439 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.58□□□□□ -2
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TY2A-OR1Q12439 YOL159CYOL159C 516 nt2.58□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YJL181WYJL181W 1836 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 ECM29YHL030W 5607 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YDR269CYDR269C 324 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 CRG1YHR209W 876 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 RPS22AYJL190C 393 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YLR334CYLR334C 381 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 CYR1YJL005W 6081 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 GEA1YJR031C 4227 nt2.57□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 SRB8YCR081W 4284 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 VPS64YDR200C 1815 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 RTT10YPL183C 3042 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 AXL1YPR122W 3627 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 RPS1AYLR441C 768 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 ZEO1YOL109W 342 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 SEC26YDR238C 2922 nt2.56□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 RAX2YLR084C 3663 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 PRP8YHR165C 7242 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YER087C-AYER087C-A 552 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 RRF1YHR038W 693 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 HRD3YLR207W 2502 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 YML084WYML084W 309 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 ERP4YOR016C 624 nt2.55□□□□□ -2
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TY2A-OR1Q12439 RPO41YFL036W 4056 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 NFT1YKR103W 3657 nt2.55□□□□□ -2
TY2A-OR1Q12439 SNU114YKL173W 3027 nt2.55□□□□□ -2
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