Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CGNL1Q0VF96 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CGNL1Q0VF96 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms