Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC15Q0P6D6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms