Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DSC1Q08554 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DSC1Q08554 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms