Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CXCL9Q07325 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CXCL9Q07325 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms