Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC18A2Q05940 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms