Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PTPN12Q05209 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTPN12Q05209 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPN12Q05209 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms