Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 RGL1YPL066W 1440 nt2.59□□□□□ -2
SYF1Q04048 RRI2YOL117W 1938 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YDL187CYDL187C 330 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 RPL29YFR032C-A 180 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YGR293CYGR293C 462 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YJR141WYJR141W 1044 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 MEI5YPL121C 669 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 PSD2YGR170W 3417 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 CBF2YGR140W 2871 nt2.58□□□□□ -2
SYF1Q04048 SGM1YJR134C 2124 nt2.57□□□□□ -2
SYF1Q04048 SIR3YLR442C 2937 nt2.57□□□□□ -2
SYF1Q04048 ECM5YMR176W 4236 nt2.57□□□□□ -2
SYF1Q04048 CRD1YDL142C 852 nt2.57□□□□□ -2
SYF1Q04048 CHZ1YER030W 462 nt2.57□□□□□ -2
SYF1Q04048 PEX8YGR077C 1770 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 NUP100YKL068W 2880 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 TFC3YAL001C 3483 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 VPS16YPL045W 2397 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 TWF1YGR080W 999 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 PEX4YGR133W 552 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 DFG10YIL049W 762 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 STE18YJR086W 333 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 SNU114YKL173W 3027 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 PES4YFR023W 1836 nt2.56□□□□□ -2
SYF1Q04048 SAK1YER129W 3429 nt2.55□□□□□ -2
SYF1Q04048 LAG1YHL003C 1236 nt2.55□□□□□ -2
SYF1Q04048 YLR302CYLR302C 363 nt2.55□□□□□ -2
SYF1Q04048 IGO1YNL157W 507 nt2.55□□□□□ -2
SYF1Q04048 GIS1YDR096W 2685 nt2.55□□□□□ -2
SYF1Q04048 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 ILM1YJR118C 612 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 RCN2YOR220W 798 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 TRS20YBR254C 528 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 MLH1YMR167W 2310 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 EDS1YBR033W 2760 nt2.54□□□□□ -2
SYF1Q04048 ASG1YIL130W 2895 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 ANS1YHR126C 480 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 YJR023CYJR023C 402 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 YLR202CYLR202C 327 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 YMR320WYMR320W 306 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 SWM2YNR004W 441 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 ATP3YBR039W 936 nt2.53□□□□□ -2
SYF1Q04048 SEC16YPL085W 6588 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PRK1YIL095W 2433 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 SSF2YDR312W 1362 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 TUS1YLR425W 3924 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 MET32YDR253C 576 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 MTC7YEL033W 420 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 RAD6YGL058W 519 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 GIC1YHR061C 945 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 SWS2YNL081C 432 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 SPR3YGR059W 1539 nt2.52□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 SSF1YHR066W 1362 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 NDD1YOR372C 1665 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YDL016CYDL016C 303 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YFH1YDL120W 525 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YDR509WYDR509W 348 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 CIC1YHR052W 1131 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YIL058WYIL058W 285 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 IST3YIR005W 447 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YLR252WYLR252W 306 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 LSM2YBL026W 288 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 UBX4YMR067C 1251 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 SSD1YDR293C 3753 nt2.51□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 HNT1YDL125C 477 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YRB1YDR002W 606 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 BET4YJL031C 984 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 UTP30YKR060W 825 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 ARV1YLR242C 966 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 BER1YLR412W 825 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 RPL25YOL127W 429 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 GIP3YPL137C 3831 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YPR096CYPR096C 303 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YBR277CYBR277C 402 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 PHO2YDL106C 1680 nt2.5□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 MMS22YLR320W 4365 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YPK1YKL126W 2043 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 BI4Q0120 1917 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YGL165CYGL165C 579 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 HYR1YIR037W 492 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 EAF6YJR082C 342 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 AFB1YLR040C 675 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YPL080CYPL080C 327 nt2.49□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 MRP10YDL045W-A 288 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YDR199WYDR199W 366 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YFR056CYFR056C 369 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YGL015CYGL015C 393 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 SPO13YHR014W 876 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YIR020CYIR020C 303 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 RAM2YKL019W 951 nt2.48□□□□□ -2.01
SYF1Q04048 YHC1YLR298C 696 nt2.48□□□□□ -2.01
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