Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP27A1Q02318 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP27A1Q02318 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms