Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
XPCQ01831 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
XPCQ01831 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
XPCQ01831 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
XPCQ01831 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
XPCQ01831 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms