Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXK2Q01167 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FOXK2Q01167 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms