Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1BQ00975 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1BQ00975 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms