Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2BQ00403 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2BQ00403 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms