Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NUCB2P80303 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUCB2P80303 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms