Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PITX1P78337 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PITX1P78337 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PITX1P78337 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PITX1P78337 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PITX1P78337 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PITX1P78337 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms