Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ERVK-24P63145 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-24P63145 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms