Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPD2P62316 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPD2P62316 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms