Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE2HP62256 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE2HP62256 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms