Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NCS1P62166 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NCS1P62166 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NCS1P62166 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NCS1P62166 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NCS1P62166 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NCS1P62166 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCS1P62166 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NCS1P62166 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms