Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATP12AP54707 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP12AP54707 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms