Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
SMARCA2P51531 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
SMARCA2P51531 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
SMARCA2P51531 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms