Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ETV1P50549 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ETV1P50549 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ETV1P50549 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ETV1P50549 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms