Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CSNK1EP49674 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CSNK1EP49674 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms