Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PRIM1P49642 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRIM1P49642 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms