Protein–RNA interactions for Protein: P46781

RPS9, 40S ribosomal protein S9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS9P46781 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPS9P46781 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPS9P46781 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPS9P46781 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPS9P46781 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RPS9P46781 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPS9P46781 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPS9P46781 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS9P46781 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms