Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GRIA3P42263 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GRIA3P42263 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms