Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PTGDSP41222 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms