Protein–RNA interactions for Protein: P40462

TMA108, Protein TMA108, yeast

Predictions only

Length 946 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TMA108	P40462	RRT1	YBL048W	312 nt		2.62	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YNL146C-A	YNL146C-A	195 nt		2.62	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	FLO11	YIR019C	4104 nt		2.62	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	EDS1	YBR033W	2760 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	SAP1	YER047C	2694 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	FKS3	YMR306W	5358 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	MDM32	YOR147W	1869 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	NEW1	YPL226W	3591 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	BRO1	YPL084W	2535 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YCR001W	YCR001W	315 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	MET32	YDR253C	576 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	RNR4	YGR180C	1038 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	MRPL44	YMR225C	297 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YOR050C	YOR050C	348 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	PSD2	YGR170W	3417 nt		2.61	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	SMC6	YLR383W	3345 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	ARP8	YOR141C	2646 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	snR70	snR70	164 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	CIC1	YHR052W	1131 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	EMC6	YLL014W	327 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	PAU8	YAL068C	363 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	PAU20	YOL161C	363 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	TOA1	YOR194C	861 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	SPC29	YPL124W	762 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	KIN82	YCR091W	2163 nt		2.6	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YRB1	YDR002W	606 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	IRC4	YDR540C	540 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	HYP2	YEL034W	474 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	MXR1	YER042W	555 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	PRM8	YGL053W	714 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	SPC1	YJR010C-A	285 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YKL044W	YKL044W	321 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YKL202W	YKL202W	582 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	UTP30	YKR060W	825 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YLR154W-A	YLR154W-A	186 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	URA10	YMR271C	684 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YNL122C	YNL122C	348 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	PHO80	YOL001W	882 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YOR055W	YOR055W	435 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YOR105W	YOR105W	327 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	YBR209W	YBR209W	318 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	TUS1	YLR425W	3924 nt		2.59	□□□□□ -1.99
TMA108	P40462	PHO2	YDL106C	1680 nt		2.59	□□□□□ -2
TMA108	P40462	UBP11	YKR098C	2154 nt		2.59	□□□□□ -2
TMA108	P40462	MMS22	YLR320W	4365 nt		2.58	□□□□□ -2
TMA108	P40462	HNT1	YDL125C	477 nt		2.58	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YGR045C	YGR045C	363 nt		2.58	□□□□□ -2
TMA108	P40462	SHE2	YKL130C	741 nt		2.58	□□□□□ -2
TMA108	P40462	ATX2	YOR079C	942 nt		2.58	□□□□□ -2
TMA108	P40462	PTC5	YOR090C	1719 nt		2.58	□□□□□ -2
TMA108	P40462	NAN1	YPL126W	2691 nt		2.57	□□□□□ -2
TMA108	P40462	PHR1	YOR386W	1698 nt		2.57	□□□□□ -2
TMA108	P40462	ICY1	YMR195W	384 nt		2.57	□□□□□ -2
TMA108	P40462	SNU56	YDR240C	1479 nt		2.57	□□□□□ -2
TMA108	P40462	VPS41	YDR080W	2979 nt		2.57	□□□□□ -2
TMA108	P40462	REV1	YOR346W	2958 nt		2.57	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YPR097W	YPR097W	3222 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	HMLALPHA2	YCL067C	633 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	MATALPHA2	YCR039C	633 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YFH1	YDL120W	525 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	FMP16	YDR070C	282 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YIL030W-A	YIL030W-A	339 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YIL156W-B	YIL156W-B	222 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	PET191	YJR034W	327 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	MSL5	YLR116W	1431 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	UTP13	YLR222C	2454 nt		2.56	□□□□□ -2
TMA108	P40462	EAF6	YJR082C	342 nt		2.55	□□□□□ -2
TMA108	P40462	LCL2	YLR104W	396 nt		2.55	□□□□□ -2
TMA108	P40462	ESC1	YMR219W	4977 nt		2.55	□□□□□ -2
TMA108	P40462	PHO91	YNR013C	2685 nt		2.55	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YPL039W	YPL039W	951 nt		2.55	□□□□□ -2
TMA108	P40462	RPL36B	YPL249C-A	303 nt		2.55	□□□□□ -2
TMA108	P40462	SPE1	YKL184W	1401 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	MRP10	YDL045W-A	288 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	Q0142	Q0142	177 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	RPL37A	YLR185W	267 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	CCW14	YLR390W-A	717 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	LSM7	YNL147W	348 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	SVS1	YPL163C	783 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	INO80	YGL150C	4470 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	NUM1	YDR150W	8247 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	SSY1	YDR160W	2559 nt		2.54	□□□□□ -2
TMA108	P40462	NCL1	YBL024W	2055 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	VPS13	YLL040C	9435 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YJL070C	YJL070C	2667 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	RTR2	YDR066C	591 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YEL018C-A	YEL018C-A	534 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	TIM9	YEL020W-A	264 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	RPS17A	YML024W	411 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YPL205C	YPL205C	345 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	BNR1	YIL159W	4128 nt		2.53	□□□□□ -2
TMA108	P40462	YDR186C	YDR186C	2634 nt		2.53	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	KEL2	YGR238C	2649 nt		2.53	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	MPH1	YIR002C	2982 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	MSB1	YOR188W	3414 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	YDR098C-B	YDR098C-B	5268 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	YDR210C-D	YDR210C-D	5268 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	YDR316W-B	YDR316W-B	5268 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	YDR365W-B	YDR365W-B	5268 nt		2.52	□□□□□ -2.01
TMA108	P40462	YER138C	YER138C	5268 nt		2.52	□□□□□ -2.01

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